Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg2bQ80XK6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms