Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otop3Q80UF9 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms