Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS8

Sel1l3, Protein sel-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l3Q80TS8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sel1l3Q80TS8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sel1l3Q80TS8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms