Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lamp3Q7TST5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lamp3Q7TST5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lamp3Q7TST5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Lamp3Q7TST5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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