Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdp1Q7TSG2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms