Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek5Q7TSC3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms