Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS68

Nsun6, Putative methyltransferase NSUN6, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun6Q7TS68 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nsun6Q7TS68 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nsun6Q7TS68 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms