Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf18Q7TS55 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf18Q7TS55 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms