Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Actn1Q7TPR4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms