Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp397Q7TNK4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms