Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn4bQ7M729 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms