Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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