Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SynmQ70IV5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SynmQ70IV5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms