Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2r2Q6ZWZ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms