Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Topbp1Q6ZQF0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Topbp1Q6ZQF0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms