Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf3Q6ZQA6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms