Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm3bQ6ZPY7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm3bQ6ZPY7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms