Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf653Q6YND2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf653Q6YND2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms