Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic3Q6X1Y6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic3Q6X1Y6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms