Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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