Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff1Q6PFE7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms