Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad54bQ6PFE3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms