Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cachd1Q6PDJ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms