Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mfsd4aQ6PDC8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms