Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fhod1Q6P9Q4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fhod1Q6P9Q4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms