Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx6Q6P8X1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms