Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms