Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf728Q6P5C7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Znf728Q6P5C7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Znf728Q6P5C7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Znf728Q6P5C7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Znf728Q6P5C7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf728Q6P5C7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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