Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Podnl1Q6P3Y9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Podnl1Q6P3Y9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms