Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Wdr44Q6NVE8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms