Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms