Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm4Q6IRU2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tpm4Q6IRU2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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