Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms