Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scaf8Q6DID3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms