Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spty2d1Q68FG3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spty2d1Q68FG3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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