Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4fQ66X05 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms