Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CilpQ66K08 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms