Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms