Protein–RNA interactions for Protein: Q64701

Rbl1, Retinoblastoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbl1Q64701 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbl1Q64701 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms