Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Top2bQ64511 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2bQ64511 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms