Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Abcg1Q64343 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abcg1Q64343 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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