Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf4Q64287 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms