Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pan3Q640Q5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 395.3 ms