Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc18Q640L5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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