Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Polr2kQ63871 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms