Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20865Q62460 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms