Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CcncQ62447 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CcncQ62447 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CcncQ62447 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CcncQ62447 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CcncQ62447 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CcncQ62447 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms