Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms