Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ssr4Q62186 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ssr4Q62186 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ssr4Q62186 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssr4Q62186 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssr4Q62186 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ssr4Q62186 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssr4Q62186 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms