Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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